Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn8Q9QZ49 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms