Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms