Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkp3Q9QY23 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms