Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptf1aQ9QX98 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms