Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prg4Q9JM99 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Prg4Q9JM99 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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