Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prg3Q9JL95 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms