Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmod3Q9JHJ0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmod3Q9JHJ0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmod3Q9JHJ0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmod3Q9JHJ0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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