Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DysfQ9ESD7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DysfQ9ESD7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DysfQ9ESD7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DysfQ9ESD7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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DysfQ9ESD7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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DysfQ9ESD7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
DysfQ9ESD7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms