Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms