Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgshQ9EQ08 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms