Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms