Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Smg9Q9DB90 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Smg9Q9DB90 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Smg9Q9DB90 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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