Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco2Q9DA21 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms