Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D8Q6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms