Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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MsraQ9D6Y7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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MsraQ9D6Y7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MsraQ9D6Y7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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