Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc94Q9D6J3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc94Q9D6J3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms