Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc39Q9D5Y1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms