Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ubxn11Q9D572 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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