Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms