Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4933425L06RikQ9D3Z8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4933425L06RikQ9D3Z8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms