Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx29Q9D3S3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms