Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trappc6bQ9D289 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trappc6bQ9D289 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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