Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms