Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nde1Q9CZA6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nde1Q9CZA6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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