Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Xrcc3Q9CXE6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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