Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tdrd12Q9CWU0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tdrd12Q9CWU0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd12Q9CWU0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd12Q9CWU0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd12Q9CWU0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms