Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdca4Q9CWM2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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