Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms