Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms