Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Fcf1Q9CTH6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fcf1Q9CTH6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fcf1Q9CTH6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fcf1Q9CTH6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Fcf1Q9CTH6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fcf1Q9CTH6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fcf1Q9CTH6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fcf1Q9CTH6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fcf1Q9CTH6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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