Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9CRC3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms