Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms