Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sar1bQ9CQC9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms