Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms