Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms