Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tomm22Q9CPQ3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm22Q9CPQ3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms