Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrbp1Q99PL5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms