Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramel1Q99MW3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms