Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp11Q99K46 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp11Q99K46 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp11Q99K46 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp11Q99K46 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms