Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxp3Q99JB6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms