Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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