Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apobec3Q99J72 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms