Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf3Q922U1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms