Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp3Q91W36 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms