Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps3Q91VB4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hps3Q91VB4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms