Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc71Q8VEG0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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