Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rprd1aQ8VDS4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1aQ8VDS4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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