Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fyco1Q8VDC1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms