Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clptm1Q8VBZ3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms