Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casc3Q8K3W3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms